Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms