Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.7 ms