Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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