Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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