Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms