Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Smg9Q9DB90 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Smg9Q9DB90 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Smg9Q9DB90 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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