Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms