Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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