Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a2Q9D8F3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms