Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fip1l1Q9D824 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms