Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Capns2Q9D7J7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Capns2Q9D7J7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Capns2Q9D7J7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Capns2Q9D7J7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Capns2Q9D7J7 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms