Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc94Q9D6J3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms