Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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