Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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