Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms