Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms