Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl41Q9CQN7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms