Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms