Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms