Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q99M08 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q99M08 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms