Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms