Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms