Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms