Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc18Q8VD24 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc18Q8VD24 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms