Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms