Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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SbsnQ8CIT9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms