Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms