Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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