Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms