Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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