Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms