Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms