Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms