Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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