Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms