Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms