Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms