Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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