Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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