Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms