Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms