Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms