Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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D13Ertd608eQ3UPR8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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D13Ertd608eQ3UPR8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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