Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms