Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms