Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc10Q3TLI0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms