Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hdgfl1Q2VPR5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hdgfl1Q2VPR5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hdgfl1Q2VPR5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms