Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc162pQ0VG85 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc162pQ0VG85 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc162pQ0VG85 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc162pQ0VG85 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc162pQ0VG85 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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