Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd12Q0VE29 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms