Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms